Para que los egresados obtengan alguna de las 3 especialidades ofertadas en el título es necesario cursar un total de 8 materias entre las que se incluyen en cada una de ellas:

Especialidad en Ciencias Ambientales: para la que se ofertan 16 materias.
El perfil de los egresados de esta especialidad es el de un profesional que desarrolla su actividad de I+D+i en el campo ambiental, y que pueda contribuir al proceso productivo agroalimentario optimizando el aprovechamiento de las potencialidades de Galicia en relación a las materias primas para la industria agroalimentaria bajo la premisa de la sostenibilidad ambiental. Prestará especial atención a los procesos de degradación y pérdida de biodiversidad en los medios edáficos, hídricos y bióticos y al deterioro de los hábitats asociados.

Especialidad en Ciencias Agrarias y Alimentarias: en la que se ofertan 17 materias.
El perfil de los egresados en esta especialidad es el de un profesional que desarrolla su actividad de I+D+i en el campo de las ciencias agrarias y alimentarias para dar apoyo al desarrollo del sector de la producción ecológica y sostenible mediante la investigación de nuevas estrategias y procedimientos que garanticen la producción agroalimentaria, la calidad, seguridad alimentaria y el desarrollo del binomio alimentación-salud.

Especialidad en Procesos en la Industria agroalimentaria: donde se ofertan 17 materias.
El perfil del egresado en la especialidad es el de un investigador que desarrolla su actividad de I+D+i en los últimos avances en procesado industrial o la biotecnología, pasando por la calidad y la seguridad alimentaria para el desarrollo e implementación de nuevas tecnologías en la industria agroalimentaria, así como el desarrollo de nuevos productos y/o la valorización de los que actualmente existen en el mercado.

El estudiante también puede realizar el Máster en Ciencia y Tecnología Agroalimentaria y Ambiental sin especialidad, para lo que debe completar 8 materias optativas a escoger entre las 36 de toda la oferta de materias optativas del máster.